1 针对畜禽内源酶分泌不足的情况，选择使用消化酶
    对于猪和家禽，在一些特殊的生长发育阶段和饲养管理条件下会出现内源消化酶分泌不足的情况。选用适当的消化酶制剂弥补内源酶的不足，可以提高畜禽生产力和改善饲料利用效率。肉仔鸡的采食量远大于蛋用雏鸡，但两者胰腺消化酶的分泌近似。肉仔鸡在同样的消化酶水平下要处理更多食糜，在肉仔鸡日粮中补加外源性消化酶可能更有效。
    温度和酸碱度是影响酶作用效果的两大环境因素，各种酶都具有各自最适宜（具有最大活性）的，甚至是维持其结构和性质稳定性的环境温度和酸碱度。家禽和猪肠道酸碱度和温度相差较大，适用于猪的酶制剂品种或酶活数量不一定适用于家禽。同一类酶（如蛋白酶）可能有不同的来源和性质，如有植物、细菌和真菌来源，不同来源的同一类酶也可能有不同的环境适应性。例如，就酸碱度而言，地衣芽孢杆菌分泌的蛋白酶的稳定pH范围是8~11，最适pH值是10.5，这对于家禽就毫无意义；枯草杆菌分泌的蛋白酶的稳定pH范围是6~9，最适pH值是7.5。因此，来源不同的单酶因其适宜的作用温度、pH值、底物等不同，应该考虑不同来源的单酶之间的协同性问题。有研究表明，在猪和家禽日粮中添加外源酶对内源消化酶的分泌还有一定的促进作用。

2 针对目标底物（日粮类型）选用酶制剂的种类
    由于酶作用的底物特异性，要使饲用酶制剂发挥优良的效果，在应用时必需考虑饲料原料特性。不同饲料原料的组成和化学结构都有特殊性。在小麦和黑麦中主要的非淀粉多糖是阿拉伯木聚糖，而在大麦和燕麦中除了阿拉伯木聚糖外主要是β-葡聚糖，豆科种子中主要是果胶。可见，用于小麦豆粕型饲粮的酶应主要是木聚糖酶、果胶酶和纤维素酶，而用于大麦豆粕型饲粮的则主要是β-葡聚糖酶、果胶酶、木聚糖酶和纤维素酶。对任一底物的降解都是多种酶协同作用的结果。例如单一的木聚糖内切酶不能完全降解木聚糖，它还需要其它多种酶的协同作用才能彻底降解木聚糖。由于日粮中含有多种多样的非淀粉多糖，因此需要更为广泛的酶谱去降解这些底物。
    植物饲料原料中的植酸相对上述碳水化合物而言比较简单，它具有固定的化学结构和特性，在植酸酶的使用方面要考虑的因素也就简单的多（Cheryan，1998；Liu等，1998）。

3 根据目标底物含量确定酶制剂的适宜用量
    在日粮中使用非消化酶类的目的在于提高饲料中畜禽依靠内源酶不能消化的物质的利用率或消除其抗营养作用。若底物过少，加酶就不会产生出明显的改进效果；若底物量过多，添加的酶量或酶活性不充足，则所能降解的底物数量有限，效果也不佳。这就要求底物与酶制剂用量之间应有适宜的比例关系，根据目标底物含量，确定添加酶制剂的用量。例如，Ravindran等（1999）研究不同植酸水平（10.4，13.2，15.7g/kg）的小麦-高粱-豆粕型日粮中添加不同水平植酸酶（400，800U/kg）的结果表明，植酸水平低时添加400U/kg植酸酶就可充分提高日粮AME，在植酸水平较高的日粮中则需添加较高水平（800U/kg）植酸酶。
    添加外源酶制剂后产生的能量效应，大多数来源于包被养分（如淀粉、蛋白、脂肪等）的释放。目前，外源酶制剂尚不能完全降解经过强大的内源酶消化后的剩余物。
    饲用酶制剂中绝大多数酶活力大小的度量还没有统一标准。由于测定选用的酸碱度、温度和底物对酶活测定结果影响很大，表现出从酶活指标难以判断酶制剂质量优劣，具有相同酶活的产品，使用效果差异较大。

4 确定酶制剂的营养改进值或营养当量，优化日粮配方
    使用酶制剂的方式有两种，一是直接在根据经典的饲料营养参数设计的日粮中添加酶制剂，该方式简单易行，能提高畜禽生产性能，但将增加饲料成本；二是根据酶制剂提高畜禽生产性能和改善饲料利用的程度，适当降低根据经典的饲料营养参数设计的日粮的营养水平或利用廉价饲料原料配制日粮，这样可以做到在保持动物生产性能不下降的情况下降低饲料成本。第二种方式所能达到的完美程度依赖于配方技术人员对酶制剂和饲料原料信息的了解程度，如果能够获得某种酶制剂所能改进的饲料养分消化率的大小或相当的营养价值（可以称作“营养改进值（INV）”或“营养当量（NE）”），在制作配方时应用这些INV或NE对经典的饲料营养参数进行调整后再进行计算就可以达到较高的精准度，实现真正的优化。

5 全面考虑日粮的营养平衡、商品属性和经济成本
    酶制剂使用前后所能产生的饲喂效果的显著差异常见于一些非常规的日粮类型，譬如非淀粉多糖酶制剂应用于以麦类作为主要能量饲料的畜禽日粮中。在日粮类型发生较大变化时，只考虑酶制剂的INV或NE而力求降低日粮成本是不够的或说是偏颇的，还应该全面考虑日粮的营养平衡，对因为日粮类型改变可能导致的某些营养亏缺应进行弥补。例如，以小麦作为主要能量饲料的日粮与玉米型日粮比较就更易出现生物素缺乏。商品属性也赋予商品饲料重要的价值，饲料原料类型的改变有时也会有损用户已习惯和喜好的商品特点，如色泽等。弥补营养亏缺和商品属性都会有成本增加。

6 适当的饲料加工工艺保障酶制剂应用效果
    酶是蛋白质，除了个别酶可以在高温条件下保持结构和功效的稳定，大多数不具有耐受高热的性质。没有经过特殊稳定性处理的酶制剂很难经受住制粒工艺而仍维持较高的活力，更不能适应膨化工艺。对于必需制粒或膨化的饲料，宜采用后喷涂工艺技术将饲用酶（液态）均匀添加到配合饲料中(Steen，2004)。